D'une part, les projets ISI permettent à une équipe clinique et une équipe d’ingénierie de développer ensemble un projet de recherche en santé, porté par un binôme clinicien‑ingénieur. Ils financent également le travail conjoint d’un étudiant en ingénierie et d’un étudiant en médecine pendant un an dans le cadre d’un Master 2.

D'autre part, les thèses et post‑doctorats soutenus par l’IUIS reposent eux aussi sur un co‑encadrement associant une expertise clinique et une expertise en ingénierie. Les post‑doctorants bénéficient d’un accompagnement renforcé pour structurer leur trajectoire scientifique, consolider leurs compétences et développer des projets à fort potentiel d’innovation.

Par ailleurs, l’IUIS accompagne également les chercheurs dans le développement, la valorisation et le transfert de leurs travaux, en soutenant la maturation technologique, les démarches de propriété intellectuelle et les collaborations avec des partenaires industriels ou institutionnels.

Enfin, l’IUIS co‑finance des postes d’accueil AP‑HP qui offrent à des chefs de clinique ou praticiens hospitaliers une année en laboratoire d’ingénierie, le plus souvent pour préparer une thèse de doctorat.